MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62 chromosome

Total Repeats: 21903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012985	CCA	2	6	214	219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780122
2	NC_012985	GATG	2	8	239	246	25 %	25 %	50 %	0 %	254780122
3	NC_012985	TCT	2	6	266	271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780122
4	NC_012985	GAC	2	6	339	344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780122
5	NC_012985	AGA	2	6	380	385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780122
6	NC_012985	TTA	2	6	386	391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780122
7	NC_012985	GTT	2	6	547	552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780123
8	NC_012985	TCTT	2	8	559	566	0 %	75 %	0 %	25 %	254780123
9	NC_012985	AGG	2	6	585	590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254780123
10	NC_012985	AAG	2	6	641	646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780123
11	NC_012985	AG	3	6	645	650	50 %	0 %	50 %	0 %	254780123
12	NC_012985	TGG	2	6	783	788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254780123
13	NC_012985	ACA	2	6	1038	1043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780124
14	NC_012985	TA	3	6	1046	1051	50 %	50 %	0 %	0 %	254780124
15	NC_012985	TCA	2	6	1127	1132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780124
16	NC_012985	TTG	2	6	1162	1167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780124
17	NC_012985	TTG	2	6	1330	1335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780124
18	NC_012985	AAC	2	6	1374	1379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780124
19	NC_012985	TGT	2	6	1390	1395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780124
20	NC_012985	TGCAT	2	10	1406	1415	20 %	40 %	20 %	20 %	254780124
21	NC_012985	TAT	2	6	1460	1465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780124
22	NC_012985	AATG	2	8	1497	1504	50 %	25 %	25 %	0 %	254780124
23	NC_012985	AG	4	8	1550	1557	50 %	0 %	50 %	0 %	254780124
24	NC_012985	AAGC	2	8	1580	1587	50 %	0 %	25 %	25 %	254780124
25	NC_012985	ATG	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780124
26	NC_012985	TGT	2	6	1678	1683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780124
27	NC_012985	CAAC	2	8	1705	1712	50 %	0 %	0 %	50 %	254780124
28	NC_012985	AGATG	2	10	1781	1790	40 %	20 %	40 %	0 %	254780124
29	NC_012985	GAA	2	6	1911	1916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780124
30	NC_012985	TGA	2	6	1982	1987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780124
31	NC_012985	C	6	6	2044	2049	0 %	0 %	0 %	100 %	254780124
32	NC_012985	CAA	2	6	2059	2064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780124
33	NC_012985	ACAA	3	12	2061	2072	75 %	0 %	0 %	25 %	254780124
34	NC_012985	CAA	2	6	2317	2322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780125
35	NC_012985	AT	3	6	2352	2357	50 %	50 %	0 %	0 %	254780125
36	NC_012985	TATCA	2	10	2485	2494	40 %	40 %	0 %	20 %	254780125
37	NC_012985	GAG	2	6	2567	2572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254780125
38	NC_012985	GAA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780125
39	NC_012985	CAAG	2	8	2683	2690	50 %	0 %	25 %	25 %	254780125
40	NC_012985	TTG	2	6	2714	2719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780125
41	NC_012985	ACG	2	6	2802	2807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780125
42	NC_012985	AG	3	6	2853	2858	50 %	0 %	50 %	0 %	254780125
43	NC_012985	AAAC	2	8	2869	2876	75 %	0 %	0 %	25 %	254780125
44	NC_012985	TTC	2	6	2877	2882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780125
45	NC_012985	TG	3	6	2961	2966	0 %	50 %	50 %	0 %	254780125
46	NC_012985	GCA	2	6	2977	2982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780125
47	NC_012985	TCGTT	2	10	3027	3036	0 %	60 %	20 %	20 %	254780125
48	NC_012985	AATT	2	8	3048	3055	50 %	50 %	0 %	0 %	254780125
49	NC_012985	AC	3	6	3057	3062	50 %	0 %	0 %	50 %	254780125
50	NC_012985	TAA	2	6	3086	3091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780126
51	NC_012985	AACT	2	8	3098	3105	50 %	25 %	0 %	25 %	254780126
52	NC_012985	TC	3	6	3281	3286	0 %	50 %	0 %	50 %	254780126
53	NC_012985	CGG	2	6	3302	3307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254780126
54	NC_012985	CTT	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780126
55	NC_012985	AC	3	6	3386	3391	50 %	0 %	0 %	50 %	254780126
56	NC_012985	ACAG	2	8	3400	3407	50 %	0 %	25 %	25 %	254780126
57	NC_012985	GAA	2	6	3423	3428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780126
58	NC_012985	GAGG	2	8	3483	3490	25 %	0 %	75 %	0 %	254780126
59	NC_012985	T	6	6	3491	3496	0 %	100 %	0 %	0 %	254780126
60	NC_012985	TTC	2	6	3595	3600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780126
61	NC_012985	ATG	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780126
62	NC_012985	TCT	2	6	3912	3917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780127
63	NC_012985	TG	3	6	3944	3949	0 %	50 %	50 %	0 %	254780127
64	NC_012985	CA	3	6	3953	3958	50 %	0 %	0 %	50 %	254780127
65	NC_012985	AAG	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780127
66	NC_012985	GAA	2	6	4120	4125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780127
67	NC_012985	GATT	2	8	4161	4168	25 %	50 %	25 %	0 %	254780127
68	NC_012985	AG	3	6	4255	4260	50 %	0 %	50 %	0 %	254780127
69	NC_012985	AAG	2	6	4396	4401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780127
70	NC_012985	TAT	2	6	4434	4439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780127
71	NC_012985	CAT	2	6	4592	4597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780127
72	NC_012985	TG	3	6	4711	4716	0 %	50 %	50 %	0 %	254780127
73	NC_012985	GGA	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254780127
74	NC_012985	CAT	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780127
75	NC_012985	TTG	3	9	4871	4879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780127
76	NC_012985	ACA	2	6	5121	5126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780127
77	NC_012985	TCA	2	6	5184	5189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780127
78	NC_012985	TTC	2	6	5294	5299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780127
79	NC_012985	AAG	2	6	5342	5347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780127
80	NC_012985	TGA	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780127
81	NC_012985	TCA	2	6	5434	5439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780127
82	NC_012985	GA	5	10	5508	5517	50 %	0 %	50 %	0 %	254780127
83	NC_012985	TGG	2	6	5523	5528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254780127
84	NC_012985	CTA	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780127
85	NC_012985	ATG	2	6	5630	5635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780127
86	NC_012985	TGA	2	6	5693	5698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780127
87	NC_012985	A	6	6	5700	5705	100 %	0 %	0 %	0 %	254780127
88	NC_012985	CAGA	2	8	5793	5800	50 %	0 %	25 %	25 %	254780128
89	NC_012985	TTG	2	6	5846	5851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780128
90	NC_012985	AGAT	2	8	5891	5898	50 %	25 %	25 %	0 %	254780128
91	NC_012985	ATC	2	6	5901	5906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780128
92	NC_012985	TGG	2	6	5925	5930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254780128
93	NC_012985	CAG	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780128
94	NC_012985	AGA	2	6	5984	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780128
95	NC_012985	ACG	2	6	5993	5998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780128
96	NC_012985	GGA	2	6	6032	6037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254780128
97	NC_012985	GAA	2	6	6054	6059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780128
98	NC_012985	GTCCT	2	10	6210	6219	0 %	40 %	20 %	40 %	254780129
99	NC_012985	TAT	2	6	6220	6225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780129
100	NC_012985	ATT	2	6	6365	6370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780129
101	NC_012985	TTG	3	9	6432	6440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780129
102	NC_012985	GA	3	6	6644	6649	50 %	0 %	50 %	0 %	254780129
103	NC_012985	CAA	2	6	6662	6667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780129
104	NC_012985	TCT	2	6	6674	6679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780129
105	NC_012985	AGA	2	6	6726	6731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780129
106	NC_012985	TGA	2	6	6830	6835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780130
107	NC_012985	GA	3	6	6881	6886	50 %	0 %	50 %	0 %	254780130
108	NC_012985	TAC	2	6	6952	6957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780130
109	NC_012985	GAA	2	6	6961	6966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780130
110	NC_012985	AAG	2	6	6977	6982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780130
111	NC_012985	ATG	2	6	6986	6991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780130
112	NC_012985	TCA	2	6	7013	7018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780130
113	NC_012985	GCC	2	6	7033	7038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254780130
114	NC_012985	TAT	2	6	7041	7046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780130
115	NC_012985	TGT	2	6	7163	7168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780130
116	NC_012985	TGG	2	6	7243	7248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254780130
117	NC_012985	AGA	2	6	7254	7259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780130
118	NC_012985	GAT	2	6	7269	7274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780130
119	NC_012985	TAT	2	6	7333	7338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780130
120	NC_012985	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780130
121	NC_012985	A	6	6	7425	7430	100 %	0 %	0 %	0 %	254780130
122	NC_012985	ATA	2	6	7491	7496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780131
123	NC_012985	TTC	2	6	7542	7547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780131
124	NC_012985	GC	3	6	7555	7560	0 %	0 %	50 %	50 %	254780131
125	NC_012985	A	6	6	7585	7590	100 %	0 %	0 %	0 %	254780131
126	NC_012985	GAT	2	6	7618	7623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780131
127	NC_012985	CAT	2	6	7655	7660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780131
128	NC_012985	TAT	2	6	7670	7675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780131
129	NC_012985	GAC	2	6	7682	7687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780131
130	NC_012985	TGA	2	6	7765	7770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780131
131	NC_012985	ATC	2	6	7773	7778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780131
132	NC_012985	ACC	2	6	7848	7853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780132
133	NC_012985	GGT	2	6	7865	7870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254780132
134	NC_012985	CGA	2	6	7914	7919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780132
135	NC_012985	TC	3	6	7960	7965	0 %	50 %	0 %	50 %	254780132
136	NC_012985	AAC	2	6	8009	8014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780132
137	NC_012985	TAC	2	6	8031	8036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780132
138	NC_012985	AGA	2	6	8048	8053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780132
139	NC_012985	TAA	2	6	8057	8062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780132
140	NC_012985	TCA	2	6	8102	8107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780132
141	NC_012985	CCT	2	6	8166	8171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254780132
142	NC_012985	AATT	2	8	8182	8189	50 %	50 %	0 %	0 %	254780132
143	NC_012985	AAT	2	6	8280	8285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780132
144	NC_012985	A	6	6	8342	8347	100 %	0 %	0 %	0 %	254780132
145	NC_012985	AAAC	2	8	8432	8439	75 %	0 %	0 %	25 %	254780133
146	NC_012985	GATTGA	2	12	8445	8456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780133
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148	NC_012985	TCC	2	6	8564	8569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254780134
149	NC_012985	TAT	2	6	8610	8615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780134
150	NC_012985	CGT	2	6	8634	8639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254780134
151	NC_012985	AT	3	6	8720	8725	50 %	50 %	0 %	0 %	254780134
152	NC_012985	GAA	2	6	8738	8743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780134
153	NC_012985	ACT	2	6	8748	8753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780134
154	NC_012985	GATCA	2	10	8841	8850	40 %	20 %	20 %	20 %	254780134
155	NC_012985	TTCG	2	8	8899	8906	0 %	50 %	25 %	25 %	254780134
156	NC_012985	CTT	2	6	8932	8937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780134
157	NC_012985	TGT	2	6	9139	9144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780134
158	NC_012985	ATC	2	6	9237	9242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780134
159	NC_012985	CTT	2	6	9273	9278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780134
160	NC_012985	GAAA	2	8	9296	9303	75 %	0 %	25 %	0 %	254780134
161	NC_012985	T	6	6	9305	9310	0 %	100 %	0 %	0 %	254780134
162	NC_012985	TAA	2	6	9314	9319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780134
163	NC_012985	TAA	2	6	9389	9394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780134
164	NC_012985	GAT	2	6	9579	9584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780134
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166	NC_012985	ATA	2	6	9892	9897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780135
167	NC_012985	ATG	2	6	9997	10002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780135
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169	NC_012985	TTTC	2	8	10044	10051	0 %	75 %	0 %	25 %	254780135
170	NC_012985	AT	3	6	10097	10102	50 %	50 %	0 %	0 %	254780135
171	NC_012985	ATTG	2	8	10167	10174	25 %	50 %	25 %	0 %	254780135
172	NC_012985	TGA	2	6	10277	10282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780135
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178	NC_012985	CGA	2	6	10547	10552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780135
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255	NC_012985	CTT	2	6	15109	15114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780137
256	NC_012985	T	6	6	15135	15140	0 %	100 %	0 %	0 %	254780137
257	NC_012985	T	6	6	15148	15153	0 %	100 %	0 %	0 %	254780137
258	NC_012985	CGA	2	6	15513	15518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780138
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260	NC_012985	AAAAT	2	10	15643	15652	80 %	20 %	0 %	0 %	254780138
261	NC_012985	AC	3	6	15667	15672	50 %	0 %	0 %	50 %	254780138
262	NC_012985	ATT	2	6	15681	15686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780138
263	NC_012985	A	6	6	15711	15716	100 %	0 %	0 %	0 %	254780138
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265	NC_012985	T	7	7	15745	15751	0 %	100 %	0 %	0 %	254780138
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394	NC_012985	CATT	2	8	21566	21573	25 %	50 %	0 %	25 %	254780142
395	NC_012985	TAA	2	6	21585	21590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780142
396	NC_012985	ATC	2	6	21592	21597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780142
397	NC_012985	CTA	2	6	21654	21659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780142
398	NC_012985	T	6	6	21680	21685	0 %	100 %	0 %	0 %	254780142
399	NC_012985	TTGA	2	8	21700	21707	25 %	50 %	25 %	0 %	254780142
400	NC_012985	TCA	2	6	21768	21773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780142
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403	NC_012985	ACC	2	6	21835	21840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780142
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426	NC_012985	ACA	2	6	22856	22861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780142
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490	NC_012985	TTC	2	6	25809	25814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
491	NC_012985	CGA	2	6	25907	25912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780143
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495	NC_012985	CAA	2	6	26162	26167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780143
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498	NC_012985	GA	3	6	26313	26318	50 %	0 %	50 %	0 %	254780143
499	NC_012985	AGGCG	2	10	26343	26352	20 %	0 %	60 %	20 %	254780143
500	NC_012985	T	6	6	26366	26371	0 %	100 %	0 %	0 %	254780143

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